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partita Iva + Codice Fiscale e lavoro autonomo. come posso avere il permesso

Salve,
Sono un ragazzo egziano ,entrato in italia 15 giorni fa , con un visto shining di estonia  tipo (c)  per una settimana.
sono entrato in italia poi partito per estonia per fare un lavoro poi mi sono ritornato qua di nuovo. sto con mio cuginoo a casa sua (lui ha permesso per motivi familiari)
ho fatto tutti i documenti quasi in italia.
ho avuto il Codice Fiscale poi la partita Iva come CONSULENZA NEL SETTORE DELLE TECNOLOGIE DELL'INFORMATI e TIPO DI DOCUMENTO : ditta individuale.
(e come ho letto nella legge non c'è nessuna differenza tra lavoro autonomo e libero professionista).
Come posso avere il permesso di soggiorno per lavoro autonomo???
se  non e' questo lavoro autonomo allora cosa vuole dire una partita iva TIPO DI DOCUMENTO : ditta individuale ?
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scrivo qua perche non ho trovato nessun info su questa cosa..  partita Iva + Codice Fiscale e anche gia' ho fatturato due fatture sul territorio italiano per 4000 euro e non posso avere il permesso di soggiorno.!!!
potete aiutarmi per aspere cosa devo fare per avere il permesso . perche  cosi sto lavorando regolare con partita iva e mi tratto regolarmente cone agenzie con la mia partia' iva , passaporto e  il tesserino codice fiscale ma la mia residenza non e' irregolare e non capisco come mai questa cosa....
aspetto una vostra risposta.
Grazie