...io sinceramente non ho ben capito la tua domanda; quando arriva il decreto di concessione alla prefettura, la questura ha già dato il suo parere favorevole in merito alla pratica e non ha più niente da dire o fare la questura.
Se vuoi sapere invece cosa deve esprimere la questura nel suo parere non lo so; tuttavia credo che le questure faranno i controlli circa la regolarità del permesso/carta di soggiorno, l'ingresso in italia, denuncie e cose del genere, però non ne sono sicuro.